Os Núcleos de Gestão de Projetos (NUPROJ) são equipes que compõem a “Rede de Projetos SC”. Atuam no gerenciamento dos projetos a cargo de seu órgão ou entidade, com a coordenação do EPROJ e direcionamento da SEPLAN. Os Núcleos foram estruturados pelo EPROJ em 33 órgãos e entidades estaduais, a partir de quatro etapas: junho de 2020, junho de 2021, janeiro de 2022 e agosto de 2024. Suas atividades foram regulamentadas através do Decreto nº 632 de junho de 2020, definindo que sua atuação deverá ser de forma coordenada com a chefia competente no planejamento e na execução de projetos e programas, garantindo a observância da cultura de gestão de projetos definida pela Administração Pública Estadual do Poder Executivo.